二维动画制作与三维动画制作的区别就在于：二维动画是平面动画，三维动画是立体动画。制作流程、效率、优势都不一样，场景和角色的处理方式、表现程度以及经费支出的侧重点也不相同。
二维动画多用于纸张、照片或计算机屏幕显示，二维动画的制作基本都在平面中进行，无论画面的立体感有多强，终究只是在二维空间，故仿真度较差。 二维动画大多数是只通过手绘就能完成各个镜头。

三维动画可以反映真实世界的场景，需要设计的东西非常繁杂，包括模型、材质、灯光等等。原画师根据故事原稿画出大致的二维角色和场景，然后通过三维软件创建模型，为每个物体制作动画效果，动画做好之后，接着就赋予其需要的材质，配上灯光，渲染输出之后，还需要依靠后期软件进行分镜头的组接，再配以特效、音效等，使之成为完整的三维动画影片。

二者的不同从效果上最为明显，二维动画构图简单、传达明确；三维动画生动立体、吸引力强。客户可根据需求和预算选择适合自己的动画。